Juhatuse liikmed:

AINA ALUNURM

Juhatuse esimees
JKS liige al 2006, juhatuse liige al 2012

EVE VAIGU

Juhatuse liige
JKS liige al 2008, juhatuse liige al 2014

MAIA PUNAK

Juhatuse liige
JKS liige al 2013, juhatuse liige al 2014

HELJU SARAPUU

Juhatuse liige
JKS liige al 2009, juhatuse liige al 2020

Johannes Käisi Seltsi I juhatuse koosseisu kuulusid:

Juhatuse esimees Paul Lehestik (Põlva Keskkooli direktor, kodu-uurija ja pedagoogikaloolane, I Johannes Käisi nimelise preemia laureaat)
Ferdinand Eisen (Ühiskondliku Pedagoogika Uurimise Instituudi teadur, Tallinna Pedagoogilise Instituudi õppejõud, eksminister, pedagoogikateadlane; I Johannes Käisi nimelise preemia laureaat)
Jaan Eilart (Eesti Looduskaitse Seltsi esimees ja auesimees, Tartu Ülikooli õppejõud, biogeograaf, kultuuriloolane)
Tiiu Kiudorv (Põlvamaa haridusosakonna metoodik, Põlva Keskkooli õpetaja ja õppealajuhataja, rahvatantsupedagoog)
Heino Mägi (Otepää Keskkooli direktor, pedagoog)

Johannes Käisi Seltsi juhatuse esimehed

2014 – … Aina Alunurm
2009 – 2013 Anne Koppel
2004 – 2008 Arvi Leosk
2002 – 2003 Pille Liblik (A.Leosk taandas ennast ajutiselt)
1995 – 2001 Arvi Leosk
1990 – 1994 Paul Lehestik

*

1990 – 2008 oli juhatuse liige ja sekretär Tiiu Kiudorv

Johannes Käisi Seltsi juhatuse liikmed läbi aegade:

Aina Alunurm, Jaan Eilart, Ferdinand Eisen, Eha Jakobson, Tiiu Kiudorv, Anne Koppel, Ilmar Kopso, Mihkel Kübar, Paul Lehestik, Arvi Leosk, Kaja Lepik, Pille Liblik, Heino Mägi, Eevi Mälton, Maia Punak, Anu Sarap, Arvo Sarapuu, Helju Sarapuu, August Solo, Pille Sõrmus, Inge Unt, Eve Vaigu, Veronika Varik, Õitse Vijard, Kai Võlli