Juhatuse liikmed:
IMBI TANILSOO
Juhatuse liige
KARL TAMMISTE
Juhatuse liige
Johannes Käisi Seltsi I juhatuse koosseisu kuulusid:

Juhatuse esimees Paul Lehestik (Põlva Keskkooli direktor, kodu-uurija ja pedagoogikaloolane, I Johannes Käisi nimelise preemia laureaat)
Ferdinand Eisen (Ühiskondliku Pedagoogika Uurimise Instituudi teadur, Tallinna Pedagoogilise Instituudi õppejõud, eksminister, pedagoogikateadlane; I Johannes Käisi nimelise preemia laureaat)
Jaan Eilart (Eesti Looduskaitse Seltsi esimees ja auesimees, Tartu Ülikooli õppejõud, biogeograaf, kultuuriloolane)
Tiiu Kiudorv (Põlvamaa haridusosakonna metoodik, Põlva Keskkooli õpetaja ja õppealajuhataja, rahvatantsupedagoog)
Heino Mägi (Otepää Keskkooli direktor, pedagoog)
Johannes Käisi Seltsi juhatuse esimehed

2014 – 2025 Aina Alunurm
2009 – 2013 Anne Koppel
2004 – 2008 Arvi Leosk
2002 – 2003 Pille Liblik (A.Leosk taandas ennast ajutiselt)
1995 – 2001 Arvi Leosk
1990 – 1994 Paul Lehestik
*